입출고 도크는 쥐, 곤충, 새 특히 참새가 들어오기 쉬운 입구가 될 수 있다.  도크는 지상으로부터 최소한 1 m 이상 혹은 트럭 적재함 높이로 설치되어야 하는데 이는 쥐가 일반적으로 생각하는 것보다도 더 멀리 더 높이 뛰어 오를 수 있기 때문이다.  도크의 아래 부분은 도금 처리된 금속이나 겉이 매끄럽고 단단한 재질의 플라스틱 판으로 덮어 쥐가 타고 올라오지 못하게 해야 한다.  쥐의 접근을 막기 위해서는 도크 면이 30 ㎝ 정도 수평으로 돌출 되도록 설치해야한다 <그림 2>.  이 돌출부위가 30 ㎝ 이상인 경우 아래에 쓰레기나 비품 등이 쌓이고 채광도 안되어 위생적 사각지대가 형성되어 좋지 못하다. <그림 2. 쥐의 침입을 막을 수 있도록 고안된 도크의 구조> 벌레들이 이곳을 통해 공장 내로 들어오는 것은 고속 개폐문, air curtain, 탑차와 도크의 문을 밀폐시키는 장치 등으로 막을 수 있다.   도크 주변의 바닥은 포장을 하여 먼지가 공장 안으로 들어와 오염시키지 않도록 해야 한다.   도크 상부의 처마는 조류가 둥지를 틀거나 쉬지 못하는 구조로 만들어야 한다.  그렇지 못할 경우 제품의 출고나 원.부재료의 입고 시제품이나 원.부재료 위에 새똥이나 깃털 등이 떨어지고 공장 내부로 바로 들어갈 수도 있다.